Nat Biotechnol:研究课题不能重复?可能是HeLa细胞系“变”了

2022-01-31 02:29:51 来源:
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HeLa核酸已经在世界性的许多研究所培育了有数70年,并且直到现在被并不认为是无限供应的不逆的完全相同核酸。然而,2月底18日公开发表在《Nature Biotechnology》杂志上的一项新建模表明,核酸在相同研究所错综复杂不存在很小差别,这引发了对核酸;也建模重复特质的质疑。“我很高兴看到这项建模,但在某种意义上我并不感到惊讶,”斯隆凯特妮癌症该中所心的分子博物学家Prasad Jallepalli话说,他没有参与这项建模。这并不是HeLa核酸;也自诞生以来第一次再次出现多样化的报道:多年来,其他建模工作小组也假定了HeLa核酸性状基底错综复杂在基因序列和RNA传达的在在差别。这项简介建模首次全面分析了各种HeLa性状基底的突变性状(相同同型的HeLa核酸;也生活在世界性的各个研究所),并且首次假定突变异质特质导致了核酸传达和特异性的逆化。HeLa核酸“逆了”?在这项建模中所,建模执法人员从6个国家所的13个研究所得来了14份HeLa样本,并在完全相同的研究所有条件下进行培育。他们首先假设了基因拷贝数性状,揭示了它们序列错综复杂的在在差别。结果推断出,HeLa性状基底错综复杂,引人注意是CCL2和Kyoto性状基底错综复杂不存在着巨大的异质特质。进一步的分析表明,许多这些突变差别转化为mRNA产生的逆化,并且在较小高度上转化为核酸丰度的逆化。建模执法人员年度报告话说,HeLa CCL2和Kyoto核酸;也的RNA组和核酸组谱彼此错综复杂的差别,就像来自两种相同类别民间组织的癌核酸;也错综复杂的差别一样。HeLa性状基底在培育过程中所湿润平均速度也相同,一些核酸群并不需要17.5小时才能翻倍,而另一些核酸在完全相同的培育有条件下并不需要话费最少32小时。它们对沙门氏菌感染的反应会也有所相同:与其他两种逆基底相比,一种逆基底对感染的敏感特质极低,建模执法人员将其举例来说起码的核酸复合物,这种核酸复合物在微生物进入病原体核酸中所起效用。在一项单独的试验中中所,建模工作小组通过培育核酸;也三个月底,来观察HeLa性状基底的基因传达到底会随着时间发生逆化。建模执法人员记录了最初核酸和晚期核酸错综复杂基因传达差别大约6%。日内瓦联邦理工学院分子神经生物学建模所的Ruedi Aebersell教授是该建模的合着者,他话说,“即使在同一个研究所里,这些核酸的差别和逆化平均速度也是非常前所未见的。”他估计,如果一个建模生在项目开始时用HeLa核酸;也花钱了一个试验中,并在六个月底后被要求重复这个试验中,他们确实会给与相同的结果。关于建模中所的“可复制特质危机”的讨论大多数以外所在试验中设计、建模引人注意的缺陷,以及作为主要液压因素的受污染或贴错标签的核酸;也。但是Aebersell并不认为,HeLa核酸;也和癌核酸;也的生物学差别确实是决定性。为什么会“逆”?斯坦福大学的核酸博物学家Tim Stearns并不认为有几个确实的原因可以解释为什么核酸;也在长时间培育会有发生逆化。首先,HeLa核酸是值得注意序列不稳定的癌核酸,因此很确实随时间随机突逆。此外,它们还会在研究所中所受到各种湿润有条件的严重影响,这确实会进一步核酸进化出契合的特征。例如,他话说,灵长类核酸的培育包括将其培育到充满一个培育皿为止,从培育皿中所抽取一部分核酸,然后将它们放在另一个培育皿中所湿润,这一过程称为分裂。“每个人花钱这件冤枉的方式都太相同,”他话时说。简介这些推断出,对于人类培育核酸的建模结果的解释和展现特质有一定的意义。Aebersell和他的同冤枉在论文中所驳斥了几个具基底的的产品。首先,建模执法人员无论如何用到癌核酸;也的最初传代,并确保在同一核酸;也的相同样本中所重复同一核酸;也的试验中。来得极为重要的是,博物学家无论如何明了地年度报告他们在给定的建模中所用到的核酸;也性状基底。
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