Nat Biotechnol :深度解读!研究小组成功清楚地绘制出人类肠道的微生态系统目录!

2022-01-24 02:25:24 来源:
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近日,一项刊登在国际杂志Nature Biotechnology上题为“A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome”的研究课题报告里面,来自东欧分子生态学研究课题所等政府机构的研究课题者们通过研究课题将人类文明消化道道有机物小组里面所有已知的大肠杆菌基因组小组编订再加了一个大型的信息库系统,从而就能帮助研究课题医务人员深入即使大肠杆菌基因组和酶之间的关联性,以及其对人类文明健康的负面影响。

大肠杆菌遍布人毒素外,其能够诱发酶质来负面影响舰载机消化道、健康和对疾病的易感性,其如此普遍以至于人体有机物小组再加员的数量要比人体细胞还要多,还包括大肠杆菌、真菌和其它有机物;为了理解大肠杆菌在人类文明生态学里面所饰演的关键反派,研究课题者们通常就会在研究课题所里面受控并对其培训,随后在对大肠杆菌展开DNA人类基因组组计划,然而迄今很多大肠杆菌还不能在研究课题所的生态里面被培训繁殖。

为了获得这些大肠杆菌的相关信息,研究课题医务人员采取了另外一种工具,他们从生态里面(比如消化道道)收集实体检验,随后在对整个检验里面的DNA展开人类基因组组计划,然后利用计算机工具对来自实体检验里面的数千种品种的群体基因组小组展开重建,这种工具被称之为宏基因组小组学技术,该技术能作为一种替代工具对单个品种的DNA展开受控和人类基因组组计划。

研究课题者Rob Finn声称,去年还包括我们在内的三个独立设计团队重建了再加千上万个消化道道有机物小组基因组小组,而最大者的问题就是这些设计团队所得不到的结果是否是不具可比性,以及是否是能将这些结果编订再加为一个极为全盘的参考资料。迄今研究课题医务人员不太可能从人类文明消化道道里面超过4600种大肠杆菌群居里面编订了20万个基因组小组和1.7亿个酶质序列,这种新型的信息库系统(确立的人类文明中枢神经基因组小组等价和确立的中枢神经酶质编目)揭示了舰载机消化道道的前所未有生态系统,并为进一步展开消化道道有机物小组研究课题过渡到了柏油路。

研究课题者绘制不止的这个前所未有的编目是有机物小组研究课题的一个里程碑,将就会或将能为研究课题者们给予极为难得的资源来研究课题人类文明消化道道生态系统里面每一种大肠杆菌所饰演的关键反派。这项研究课题暗示,超过70%被探测到的大肠杆菌从而在研究课题所里面被再加功培训过,而其在毒素的活性仍然未知,而这类大肠杆菌里面最大者的群体就是Comantemales;研究课题者声称,想到Comantemales如此广泛真是一个惊喜,这就凸显了我们的确对消化道道里面的大肠杆菌知之甚少,我希望这个编目能帮助生物信息学家和分子生态学家在将就会几年补足这一科学反之亦然。

该信息库系统/编目收集的所有信息都能在在线资源Mgnify里面获得,其能帮助研究课题者们分析有机物的基因组小组信息并且与意味着的信息库系统展开对比;随着国外研究课题设计团队不断释不止新的信息库系统,该编目就会扩大到还包括其它舰载机躯干的有机物小组,比如表皮或口腔内部等躯干。再次研究课题者声称,这一编目的编订将就会或为有机物学家和临床实验课题医务人员给予极为丰富的资源,然而研究课题医务人员就会在南美洲、亚洲和非洲等代表性不足的南部发现更是多新的大肠杆菌品种,迄今研究课题医务人员并不可信多种不同年轻人里面大肠杆菌生态系统的差异和变异情况下。

完整不止处:

Alexandre Almeida, Stephen Nayfach, Miguel Boland, et al.A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome.Nat Biotechnol. 2020 Jul 20. doi: 10.1038/s41587-020-0603-3.

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