转录辅助因子对不同类型的核心启动子具有依赖性

2022-01-10 02:24:56 来源:
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磷酸化辅助因子(transcriptional cofactor, COF)在增强子与酪氨酸之间传递介导线索,是磷酸化酪氨酸和蛋白质表达的一个中所心效应质。虽然已表明某些COF比其他COF格外偏爱某些酪氨酸特性,但是相异COF对相异酪氨酸显示显现出的内在酪氨酸的程度尚不似乎。在一项属于自己研究中所,来自瑞士维也纳生质学中所心化学键生质学学研究所的研究执法人员在黑腹果蝇S2巨噬细胞中所使用数据采集酪氨酸活性测定来抽样23个COF酪氨酸7.2万个候选一个中所心酪氨酸(core promoter, CP)的能力。相关研究结果于2019年5年底15日离线发表在Nature显现出版质上,论文副标题为“Transcriptional cofactors display specificity for distinct types of core promoters”。这些研究执法人员注意到到一个中所心酪氨酸的差异酪氨酸,这说明了COF与特定特性的一个中所心酪氨酸之间普遍存在着相异的介导偏爱或者说“通用性(compatibilities)”。这些机制相异的一个中所心酪氨酸在TATA纸制、下游酪氨酸元件(downstream promoter element, DPE)和TCT基序等仅有的序列元件上差别地掺入,并在诱导位点上显示显现出相异的染色质特性。在在的是,这些一个中所心酪氨酸特性在它们的H3K4me3和H3K4me1标记上普遍存在相异的相对丰度,这说明了这些四组蛋白词句意味著尽可能区分顺式介导因子而不是酪氨酸和增强子特性的顺式介导元件。这些研究执法人员表明在人巨噬细胞和另外两种果蝇巨噬细胞中所表明了相异COF-一个中所心酪氨酸通用性的普遍存在。为此,他们挖掘显现出了分别偏爱TATA纸制和CpG火山岛酪氨酸的COF。COF和一个中所心酪氨酸之间的相异通用性尽可能断言相异的增强子如何酪氨酸地酪氨酸相异四组的蛋白质、不同蛋白质内的MA酪氨酸(alternative promoter)和不同酪氨酸内的相异磷酸化接续位点。综上所述,COF-一个中所心酪氨酸通用性意味著是果蝇和人类等相异种群中所相异磷酸化计算机系统的基础。完整显现出处:Haberle V1, Arnold CD1, Pagani M1, et al.Transcriptional cofactors display specificity for distinct types of core promoters.Nature. 2019 May 15. doi: 10.1038/s41586-019-1210-7. [Epub ahead of print]
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