Lancet Oncol:肾透明细胞肝癌与肥胖悖论相关的转录组特征分析

2022-01-03 02:02:20 来源:
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一.研究者历史背景

高血压与大肠光亮蛋白胃癌 (ccRCC)的高风险缩减有关,但高血压又矛盾地与该的预后改善有关,其潜在机制尚不恰当。现所作对高血压病症和情况下本体型病症在原发和糙周脂肪酸四组织里面的甲状腺降解和自本体核糖体四组关联同步进行研究者归纳。

本文介绍了性状同上达惹来的微环境的关联有效地暗示高血压病症的生存占优(高血压不确定性)。

二.归纳流程三.文章讲解1.COMPARZ函数调用、TCGA-KIRC函数调用、MSK自本体疗法函数调用样本查阅、矫正

在COMPARZ函数调用的453名病症里面,有375名(83%)病症具有可用的电泳样本,疗法前BMI量度以及无成果和基本上生存样本同步进行归纳(同上1)。除119名(26%)超重病症以外,来自COMPARZ试验中的最终函数调用还包括256名(68%)病症(n=256)。

同上1.COMPARZ诊疗试验中函数调用的人原则上收入流行病学和诊疗以外观上

TCGA-KIRC函数调用里面的332实有病症里面,评估了经大肠切除术疗法的152实有(46%)晚期(即AJCC III和IV期)ccRCC病症的诊疗和人原则上收入流行病学样本(同上2)。在无关59名(39%)超重病症后,最后取得的函数调用还包括93名病症(n=93)。

同上2.晚期光亮蛋白大肠蛋白胃癌TCGA-KIRC函数调用的人原则上收入学和诊疗以外观上

从62实有MSK一处脂肪酸四组织函数调用里面同步进行大肠脏切除术的非高血压光亮蛋白RCC病症里面取得了继发性和一处脂肪酸样品。在这个函数调用里面,从59名病症的PNN(大肠周靠近)一处脂肪酸,25名病症的PNA(远离大肠周)一处脂肪酸以及55名病症的四组织里面取样。在无关超重病症此后,最终函数调用还包括41名(69%)PNN结果结果显示病症, PNA结果结果显示为17(68%),结果结果显示为37(67%)。从原先的203名参加者的MSK自本体疗法研究者人集合起来里面无关74名(36%)超重病症后,总生存归纳的最终函数调用还包括129名(64%)参加者(同上3)(n=129)。

同上3. 转用MSK自本体疗法的诊疗试验中函数调用的人原则上收入流行病学和诊疗以外观上

2.高血压的大肠光亮蛋白胃癌病症远比之下情况下本体型的大肠光亮蛋白胃癌病症总生存期更长

根据KM生存归纳,在三四组里面都辨认出高血压病症的总生存期更长。在TCGA-KIRC函数调用里面,经分期校正后,高血压病症的基本上存活期长于情况下本体型四组;在COMPARZ函数调用里面,经IMDC高风险平原则上分校正后,胖病症的基本上存活期也长于情况下本体型四组。在MSK自本体疗法函数调用里面,经IMDC高风险平原则上分校正后,BMI与死亡率的无值得注意关联(如由此可知1)。

由此可知1.TCGA-KIRC函数调用 (A)、COMPARZ 函数调用(B)和MSK自本体疗法函数调用(C)的总生存期

3.COMPARZ函数调用里面高血压病症具有更好的PFS

对CPMPARZ函数调用KM归纳后,KM弧线结果显示,COMPARZ函数调用里面高血压病症比情况下本体型病症具有更好的PFS。

由此可知S1.COMPARZ函数调用里面高血压病症比情况下本体型病症具有更好的PFS

4.用到一线药物疗法,高血压病症仍具有更好的OS

KM弧线结果显示了在用到一线嘧啶趋化因子抗病毒(pazopanib或Sunitinib)的两个疗法四组里面,高血压病症的OS仍然较情况下本体型病症好。

由此可知S2.COMPARZ函数调用用到一线药物疗法四组的总生存期归纳

5.COMPARZ函数调用里面,高血压与情况下本体型的病症核糖体四组性状以外观上存在值得注意关联

做完上述归纳,所作在三个函数调用里面确认高血压不确定性存在此后,整整在COMPARZ函数调用里面对高血压和情况下本体型病症评估了核糖体四组学关联。后于做了Hallmark性状集的GSEA归纳,比较高血压病症与情况下本体型病症彼此之间的关联:高血压病症里面结果显示间歇性、TGF-β、上皮-间充质发生变化和甲状腺降解信号路中值得注意上调,提示伤口愈合简而言之的激活(由此可知A)。由此可知B是对由此可知A挑选出的几个性状同上达路中的Enrichment plots。

由此可知S4.COMPARZ函数调用里面高血压病症与情况下本体型病症的ccRCC核糖体四组性状以外观上存在值得注意关联

6.COMPARZ函数调用与TCGA-KIRC函数调用 里面高血压比情况下本体型病症的甲状腺降解平原则上分高

在GESA衍生的以外观上性状集甲状腺降解平原则上分比较里面,高血压病症很低情况下本体型病症(如由此可知2)。

由此可知2.COMPARZ函数调用(A)与TCGA-KIRC函数调用 (B)里面高血压原发病症与情况下本体型病症的甲状腺降解的z score

7.情况下本体型与高血压病症的自本体蛋白集合起来无值得注意关联

对情况下本体型(7实有)与高血压(16实有)病症的原发的主要自本体蛋白数量原则上转用流式蛋白术同步进行评估。由此可知A结果显示了高血压病症与情况下病症彼此之间的自本体蛋白集合起来的基本上关联。由此可知B恰当结果显示了高血压和情况下本体型病症T蛋白集合起来的增生水平。辨认出情况下本体型与高血压病症的自本体蛋白集合起来无显著关联,自本体蛋白增生的程度与BMI无关。

由此可知S9.用流式蛋白术归纳情况下本体型与高血压病症的自本体蛋白集合起来无显著关联

8.与情况下本体型病症远比,高血压病症糙周脂肪酸四组织水肿缩减,相比之下是靠近的糙周脂肪酸

在MSK的非高血压ccRCC病症的前瞻性函数调用里面,所作合并了20个最值得注意的丰富的IPA规范路中,这些路中来自于高血压和情况下本体型病症的PNN和PNA结果结果显示的比较(由此可知A)。高血压和情况下本体型病症的PNN和PNA结果结果显示彼此之间的自本体增生(ssGSEA平原则上分)比较(由此可知B)。

由此可知S5.与情况下本体型的病症远比,高血压病症的大肠周脂肪酸结果显示出水肿和间歇性缩减

综上,在COMPARZ试验中函数调用里面,经过IMDC高风险平原则上分变动后,辨认出远比之下情况下本体型病症,嘧啶趋化因子抗病毒疗法提高了高血压病症的生存率,特别是接受sunitinib疗法的病症。IMDC高风险平原则上分模型相关联的四反应物间接揭示寄生物因素对胃癌症系统性水肿作用(实有如贫血,里面性粒蛋白渐增,和血栓渐增症),这些因素确实也是自本体疗法结果和BMI彼此之间关联机制的原因。辨认出高血压病症的甲状腺降解分数很低情况下本体型病症,与在此此后其他的研究者得出的,参加甲状腺降解,β-氧化简而言之等等性状的富含的现象恰当。因此,甲状腺降解的关联可以部分暗示高血压病症接受嘧啶趋化因子抗病毒疗法后的更佳预后。

此研究者为高血压不确定性提供了生态学支持。在精神病ccRCC的病症观察到高血压病症远比之下情况下本体型的病症微环境的关联:特别是高血压病症的的甲状腺降解缩减,但基本上水肿无显著关联。值得注意的是高血压病症的一处脂肪酸结果显示缩减的水肿和间歇性状况。光亮蛋白胃癌与糙周脂肪酸四组织微环境的繁杂相互作用确实具有诊疗意义,值得再进一步研究者。

原始出处:

Sanchez A, Furberg H, Kuo F, Vuong L, Ged Y, Patil S, Ostrovnaya I, Petruzella S, Reising A, Patel P, Mano R, Coleman J, Russo P, Liu CH, Dannenberg AJ, Chan TA, Motzer R, Voss MH, Hakimi AA. Transcriptomic signatures related to the obesity paradox in patients with clear cell renal cell carcinoma: a cohort study.Lancet Oncol. 2020 Feb;21(2):283-293

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