Nature:肠道微生物糖类产物新功能,促进HDAC3酶活性

2021-12-13 02:30:01 来源:
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哺乳动物病原体和对其有益的共生有机物的主导进化引致了病原体-有机物关系的发展。突变表达突变修饰使得哺乳动物细胞只能整合外间自然环境接收机,促成细胞对自然环境的适应性。但是多年来以来共生的小肠有机物比如说的多种接收机通路和多种自然环境接收机是如何精准催化反应的还不甚清楚。

小肠增生座落有机物群集和病原体二者之间的界面,促成这两项屏障的形成,在身心健康时期和损伤时期对小肠视网膜同步进行补充。维持小肠增生分化流程里有多种突变表达突变机制参与其里,其里HDACs的强调对于小肠稳态更加这两项。小肠有机物比如说的短链脂肪酸丙酮卤(Butyrate)在体外抑制HDAC活性,丙酮卤处理事件后的小肠组织增生里HDAC活性下降。在未成熟雀里植入含丙酮卤的小肠有机物则会抑制小肠增生里HDAC的活性。这些结果都所述小肠有机物比如说的丙酮卤抑制HDAC的活性。但是小肠有机物与酪氨酸扯乙酰化酶活性二者之间的催化反应机制是怎样的还不得而知。

近日,美国辛辛那提儿童医院医疗里心Theresa Alenghat研究所在Nature杂志上专文 Microbiota-derived metabolite promotes HDAC3 activity in the gut,辨认出小肠有机物比如说的激酶酰卤只能闭环小肠内酪氨酸扯乙酰化酶HDAC3的活性从而促成小肠增生的重建,揭开了病原体对于小肠有机物接收机响应的具体机制。

为了揭开小肠有机物新创新陈代谢含物与突变表达突变接收机二者之间的关系,写作者们对野生同型以及小肠增生HDAC3敲除激素里的HDAC活性进性检查,辨认出野生同型对照组激素里的HDAC3强调长时间并且有着稳定的酶活性,但是小肠增生HDAC3敲除激素则反之亦然。写作者们自已知道HDAC3有否则会选择性闭环小肠有机物敏感的接收机游离。写作者们辨认出HDAC1与HDAC2在小肠增生里也有强调,但并不能补偿小肠增生里HDAC3强调的其则会。而且在对未成熟雀和小肠增生HDAC3敲除激素里的小肠增生施用HDAC广谱抑制处理事件后,辨认出在HDAC3敲除后其他种类的HDACs仍然有着活性。这些结果所述小肠有机物促成增生里HDAC3在长时间小肠稳态里的酶活性。

为了译码小肠有机物激活HDAC3的具体机制,写作者们对未成熟雀和长时间培养的激素里小肠增生里的转录谱同步进行解析。写作者们辨认出在小肠有机物假定的增生里与激酶酰新陈代谢相关的突变被广泛游离强调。前人的研究辨认出激酶三酰(Inositol trisphosphate)则会通过强化HDAC3与激活亚基的相互作用来减低HDAC3的活性。写作者们辨认出外加激酶三酰的确则会选择性减低HDAC3-NcoR重酪氨酸的活性,NcoR亚基对于HDAC3的扯乙酰化酶活性更加这两项。

全面性地,写作者们自已知道未成熟雀与对照组的激素小肠二者之间激酶三酰准确度有否假定差别。写作者们辨认出对照组激素里无论是肠腔还是小肠增生里激酶三酰的准确度都显着大于未成熟雀,所述小肠有机物的假定促成激酶三酰准确度的减低。为了评估激酶三酰对于小肠增生里HDAC3活性的负面影响,写作者们对小肠增生里的HDAC3亚基同步进行纯化并与激酶三酰同步进行主导幼鸟,辨认出激酶三酰的确只能减低内源HDAC3的活性。而且丙酮酯引致的HDAC3活性的抑制也可以被激酶三酰所合成酶。另外,写作者们还辨认出共生的小肠有机物则会通过激酶六酰(Phytate)新陈代谢途径促成小肠增生里的HDAC3的基本功能。与激酶三酰相似,激酶六酰也则会游离小肠增生里的HDAC3的活性。

为了检查小肠有机物激酶六酰依赖于的新陈代谢对于HDAC活性的负面影响,写作者们对定植野生同型以及激酶六酰酶其则会同型细菌的激素同步进行数据分析。写作者们辨认出定植激酶六酰酶长时间强调细菌的激素相比于未成熟雀以及激酶六酰其则会同型细菌激素的激酶三酰准确度升高。对激素同步进行右旋糖酐酯汞(Dextran sodium sulfate, DSS)处理事件后,则会游离激素消除小肠结核病。为了检查激酶三酰在DSS处理事件游离的小肠结核病里的作用,写作者们对未成熟雀施用激酶三酰后辨认出激酶三酰只能促成小肠从结核病里恢复并减低未成熟雀的寿命。DSS游离的大肠类似于病患里溃疡性大肠。为了全面性确认小肠有机物新陈代谢含物的基本功能,写作者们对人类整合有机物组学计划(Integrative Human Microbiome Project)里的身心健康结果显示以及溃疡性大肠症状的样品同步进行检查,辨认出在溃疡性大肠病患小肠里激酶六酰酶的丰度多于低于身心健康结果显示之里,所述激酶六酰对于小肠损伤重建是必须的。

总的来说,Alenghat研究所的工作辨认出相比于未成熟雀,小肠有机物假定的激素里HDAC3活性显着提高,这一提高是通过共生的小肠有机物比如细菌激酶六酰以及激酶三酰的新陈代谢形成的。另外,激酶三酰则会游离病患比如说的小肠类器官的植被、刺激HDAC3依赖于的增殖以及合成酶丙酮酯引发的小肠植被抑制,则会促成小肠结核病里增生的重建。因此,写作者们鉴定辨认出了HDAC3作为病原体响应多种小肠有机物接收机的汇聚突变表达异种的这两项性基本功能,揭开了小肠有机物、突变表达异种以及有机物新陈代谢含物在小肠视网膜以及小肠结核病里的这两项性催化反应和重建作用。

早期出处:

Shu-En Wu, Seika Hashimoto-Hill, Vivienne Woo, et al.Microbiota-derived metabolite promotes HDAC3 activity in the gut.Nature. 2020 Jul 30. doi: 10.1038/s41586-020-2604-2.

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